58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4552 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  100 
 
 		 328 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  69.57 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  55.44 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  70.18 
 
 		 238 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  64 
 
 		 257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  69.16 
 
 		 243 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  69.46 
 
 		 202 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  72.28 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  65.35 
 
 		 229 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  65.35 
 
 		 229 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  65.35 
 
 		 229 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  63.24 
 
 		 215 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  69.8 
 
 		 241 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  55.65 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  57.14 
 
 		 221 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  63.21 
 
 		 256 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  55.79 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  57.51 
 
 		 232 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  40.31 
 
 		 213 aa  146  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  40.62 
 
 		 207 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  42.23 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  38.19 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  34.88 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  34.16 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35.44 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  32.72 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  31.55 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  31.63 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.22 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.04 
 
 		 211 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  30.39 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.96 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  33.67 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  31.58 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  29.09 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  26.06 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.91 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  34.26 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  23.59 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  26.87 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  26.9 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  24.77 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  27.05 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  24.72 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  29.67 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  23.89 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  28.49 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>