35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0692 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  57 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  50.46 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  54.03 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  50 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  46.38 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  49.74 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  49.74 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  36.55 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  36.55 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  38.55 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  34.74 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  30.48 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.95 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  36.48 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  33.33 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  33.66 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  29.76 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  37.04 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  36.2 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  33.33 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  33.67 
 
 		 328 aa  78.6  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  30.35 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  32.81 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  32.12 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  30.65 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  31.18 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  33.85 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  34.08 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  34.08 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  34.08 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.85 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  34.31 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  30.19 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  28.74 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>