36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1451 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  54.68 
 
 
222 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  53.54 
 
 
218 aa  208  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  52.86 
 
 
216 aa  207  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  51.43 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  54.87 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  54.36 
 
 
211 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  46.38 
 
 
217 aa  168  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  34.38 
 
 
296 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  33.97 
 
 
240 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  32.98 
 
 
202 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  33.83 
 
 
215 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  32.34 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  35 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  34.04 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  30.85 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  29.59 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  29.59 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  32.07 
 
 
238 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  32.61 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  30.41 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  31.63 
 
 
241 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  32.65 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  32.65 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  32.65 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  34.34 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  30.73 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.26 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  32.22 
 
 
328 aa  74.7  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  32.32 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.33 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  33.5 
 
 
256 aa  68.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  28.71 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  27.7 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  25.74 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  26.7 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>