39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2347 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  91.47 
 
 		 211 aa  362  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  67.79 
 
 		 216 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  68.66 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  66.67 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  64.39 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  54.5 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  48.78 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  30.69 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  34.39 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  32.45 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  32.45 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  32.21 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  29.7 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  32.32 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  33 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  36.94 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  37.58 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  31.82 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.73 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  31.07 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  31.8 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  32.82 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  30.1 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  31.53 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  32.68 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  32.66 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  28.86 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  31.31 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  30.1 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  30.1 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  30.1 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.33 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  28.5 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  26.17 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  26.24 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  25.25 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  23.56 
 
 		 307 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 307 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>