70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3316 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  72.7 
 
 		 296 aa  377  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  67.39 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  64 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  69.35 
 
 		 202 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  73.76 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  73.76 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  73.76 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  70.26 
 
 		 229 aa  255  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  68.3 
 
 		 243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  64.91 
 
 		 238 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  71.94 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  61.95 
 
 		 215 aa  240  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  56.96 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  62.56 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  58.47 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  58.64 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  53.91 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  42.93 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  38.97 
 
 		 214 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  38.97 
 
 		 214 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  41.23 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  38.58 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  39.9 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  35.23 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  33.33 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.79 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  31.37 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  33.65 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.8 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.85 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.61 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  33.85 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  29.76 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.82 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  33.11 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.86 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  21.71 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  26.11 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  26.67 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 312 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  20.92 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  25.97 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 303 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  30.09 
 
 		 290 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  26.44 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  32.47 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  30.09 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  30.09 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  30.09 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  21.95 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  26.29 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  27.44 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  28.75 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  25.41 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  26.51 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  24.47 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 401 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  26.36 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  19.8 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 		 455 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.803977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  26.37 
 
 		 296 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  23.31 
 
 		 337 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>