67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4236 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  72.7 
 
 		 257 aa  355  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  66.81 
 
 		 240 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  55.44 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  64.26 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  64.26 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  64.26 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  66.67 
 
 		 202 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  62.71 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  67.48 
 
 		 229 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  65.73 
 
 		 238 aa  245  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  69.35 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  59.71 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  54.27 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  57.6 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  56.14 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  56.31 
 
 		 232 aa  205  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  59.6 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  41.38 
 
 		 213 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  38.83 
 
 		 235 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  37.37 
 
 		 207 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  38.38 
 
 		 216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  33.49 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  34.44 
 
 		 217 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.38 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  31.22 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  32.29 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.26 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.33 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  32.26 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  32.67 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.82 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  31.03 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  31.28 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.86 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  20.07 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  25.85 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  22.05 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  28.66 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  28.75 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  22.8 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  26.98 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  22.71 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  28.46 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  24.88 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  24.76 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  20.86 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  24.78 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.11 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  26.42 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  24.12 
 
 		 411 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  26.11 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.04 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>