More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0970 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 390 aa  773    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  48.64 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  44.06 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  34.24 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  30.81 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  33.06 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  33.65 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  33.08 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.51 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  24.79 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 294 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.5 
 
 		 311 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.5 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.72 
 
 		 331 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  27.94 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  29.68 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 310 aa  92.8  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  29.27 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  25.54 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  32.09 
 
 		 297 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  25.57 
 
 		 294 aa  90.5  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 285 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  27.09 
 
 		 378 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.09 
 
 		 378 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  30.46 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  30.11 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  25.46 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  26.16 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  31.02 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  27.16 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.33 
 
 		 297 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.33 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 297 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 		 297 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  28.5 
 
 		 300 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 305 aa  86.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  32.12 
 
 		 317 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  32.68 
 
 		 297 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30.86 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  28.51 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  28.04 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  28.04 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  27.57 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  25.2 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  25.2 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  27.89 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  27.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  27.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  27.57 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  27.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  26.59 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.4 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  27.57 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  30.26 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  27.57 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  24.32 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  25.48 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  24.07 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  28.9 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  24.19 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  26.02 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  25.59 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  23.93 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.27 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  26.14 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  22.79 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  25.11 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>