89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19860  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 362 aa  709    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.531716  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16660  cation diffusion facilitator family transporter  57.19 
 
 		 343 aa  343  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.819652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0116  cation diffusion facilitator family transporter  55.77 
 
 		 332 aa  316  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  25.6 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  29.06 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  23.62 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  25.73 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  23.89 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  23.96 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  25.47 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  22.01 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  23.96 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  23.96 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  22.73 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  22.73 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  23.96 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  22.73 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.73 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  22.4 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  23.96 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  23.96 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.73 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  23.61 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  23.26 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  23.61 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  23.61 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.14 
 
 		 299 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  21.72 
 
 		 297 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  20.07 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  25.21 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  26.67 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  24.46 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  25.64 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  21.17 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  21.75 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  21.95 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  23.92 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.29 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  24.35 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  25.16 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  25.52 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  26.3 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 385 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  18.82 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  27.85 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  22.15 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  26.03 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  23.91 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  21.8 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  22.48 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.02 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  22.03 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.47 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  24.02 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  24.88 
 
 		 214 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  25.94 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  25.63 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  24.88 
 
 		 214 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  21.68 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  21.32 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  25.24 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>