113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0128 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 303 aa  595  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  39.86 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  39.46 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  39.19 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  37.17 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  37.17 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  37.5 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  35.86 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  37.17 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  37.7 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 370 aa  201  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  35.5 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  27.78 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  23.31 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  28.33 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  28.35 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  29.58 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.46 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  28.11 
 
 		 227 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  28.71 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  22.48 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.98 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  21.92 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  24.35 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  24.8 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  30.81 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  31.08 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  24.76 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  24.76 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.15 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  24.12 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  22.94 
 
 		 450 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  24.89 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  22.3 
 
 		 459 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  24.71 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  25 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  21.89 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  21.82 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  23.45 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  24.53 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  27.83 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  21.64 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  23.21 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  23.21 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  23.21 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  22.31 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  25.64 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.85 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1685  CDF family cation efflux system protein  34.72 
 
 		 83 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.890428  normal  0.971407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  32.05 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  26.79 
 
 		 479 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 		 381 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1042  Co/Zn/Cd cation transporter  24.68 
 
 		 398 aa  46.2  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0463512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 		 488 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  20.54 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  24.26 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  27.46 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  24.14 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  26.03 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  22 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  21.23 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  21.09 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  31.94 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  21.36 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.28 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  24.86 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  24.86 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  29.89 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  19.25 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  26.24 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  19.25 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  22.45 
 
 		 474 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>