41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2718 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  100 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  71.29 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  68.91 
 
 		 319 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  68.59 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  68.59 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  61.89 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  59.42 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  61.04 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  55.66 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  52.27 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  43.56 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  42.9 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  45.57 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  39.56 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  37.66 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  35.53 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  30.62 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  25.72 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  24.04 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  29.6 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  29.2 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  27.49 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.87 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  25.37 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  25.62 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  24.63 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  28.19 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  25.47 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  22.95 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  23.63 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>