92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05417 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  87.84 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  58.92 
 
 		 317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  45.93 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  45.71 
 
 		 227 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  32.44 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  27.37 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  27.89 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  23.21 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  22.86 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 		 370 aa  99  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  26.14 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  24.32 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  26.81 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  28.52 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  28.69 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  28.69 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  26.17 
 
 		 329 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  24.57 
 
 		 341 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  27.36 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 		 308 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  20.69 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  20.7 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  19.22 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  18.94 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  19.64 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  24.61 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  25.27 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  23.26 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 395 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 409 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  20.65 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  23.11 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  22.56 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  22.48 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.15 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  20.59 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  22.66 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.15 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  24.88 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  19.15 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  24.18 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  21.81 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  20.87 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  22.94 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  21.08 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  19.82 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  21.98 
 
 		 476 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  21.09 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  22.49 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  20.83 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  24.33 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  23.77 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  21.48 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  20.73 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  18.98 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  21.72 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 		 459 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  21.96 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  23.9 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  21.61 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  23.02 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  23.56 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 460 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  20.73 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  20.81 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  26.21 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  21.45 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  19.65 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  24.05 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  19.66 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  23.13 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  22.95 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  21.89 
 
 		 474 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  20.27 
 
 		 390 aa  42.7  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  20.74 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  21.77 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>