71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1615 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  100 
 
 		 301 aa  606  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  23.66 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  22.82 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  25.73 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  26.47 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  21.37 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  20.38 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  20.62 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  20.53 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  22.48 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  20.15 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  20.6 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  21.36 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  21.51 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  21.54 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  20.63 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  27.65 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  25.82 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  25.82 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  21.39 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  20.53 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  21.39 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  21.39 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  19.4 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  24.78 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  24.23 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  19.2 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.18 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  23.58 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  22.17 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  21.05 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  23.63 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  20.36 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  22.29 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  21.51 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  17.49 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  24.53 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  22.49 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  24.41 
 
 		 409 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  21.21 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  22.18 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  26.87 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  28.7 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  26.87 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  22.33 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  24.86 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  21.28 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  22.4 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.95 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  21.65 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  24.08 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  19.34 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  18.82 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  23.7 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  22.27 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  21.18 
 
 		 476 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  23.58 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  21.1 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  24.35 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  21.51 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  25.37 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  22.51 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  21.51 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  21.88 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  19.63 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  21.88 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  21.88 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  21.88 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>