More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3583 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 392 aa  793    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  47.69 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  47.69 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  43.28 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  29.28 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  30.08 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  30.81 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  31.14 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  25.83 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.45 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.61 
 
 		 306 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  26.17 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  28.86 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  26.76 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  24.2 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 		 302 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  23.61 
 
 		 311 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  30 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  26.6 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  25.37 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  27.05 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.52 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  28.19 
 
 		 297 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  24.2 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  28.52 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  27.05 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 297 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  25.37 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  28.52 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.52 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  26.4 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  25.37 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  28.52 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  25.37 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  24.37 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  28.19 
 
 		 297 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  25.62 
 
 		 289 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  27.05 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1042  Co/Zn/Cd cation transporter  26.51 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0463512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  23.72 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  24.63 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  23.83 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  27.31 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  27.03 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  27.03 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  25.44 
 
 		 298 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  24.54 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  26.47 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  24.39 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  23.97 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  27.15 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  26 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  27.15 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  27.15 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  27.15 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  27.15 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  27.15 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  26.04 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  26.06 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  24.37 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  24.16 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  24.29 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  24.16 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 293 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  26.73 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 		 303 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>