90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001476 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  87.84 
 
 		 297 aa  494  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  57.38 
 
 		 317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  45.12 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  45.41 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  32.82 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  25.35 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  25.84 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  23.57 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  23.21 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  26.82 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  26.34 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  28.35 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  27.92 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  27.92 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  23.99 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  26.75 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  25.64 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  27.86 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  27.31 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  20.99 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  20.89 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  19.8 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  24.83 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  23.39 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  20.07 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  22.59 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  18.09 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  20.23 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  23.59 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  22.81 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  22.92 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  23.27 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  23.3 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  20.08 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  23.62 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  21.72 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  22.55 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  19.7 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  21.2 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  23.19 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.37 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  21.85 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  21.29 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.37 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  20.7 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  21.95 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 460 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  21.69 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  20.07 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  21.18 
 
 		 474 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  24.39 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  22.75 
 
 		 460 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  24.83 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  21.51 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  24.18 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  23.66 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  20.23 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  21.6 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  20.94 
 
 		 476 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  22.69 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  19.84 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  19.31 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  25.82 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  21.61 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  25.79 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  20.99 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  23.13 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  21.78 
 
 		 390 aa  42.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  22.79 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>