70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1874 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  100 
 
 		 268 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  39.03 
 
 		 299 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  28.3 
 
 		 301 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.82 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  31.68 
 
 		 317 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  32.44 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  26.79 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  26.79 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  37.1 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  25.37 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  26.79 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  24 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  28.2 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  23.27 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  23.64 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  24.36 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  24.36 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  25.56 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  23.64 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  25.72 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  33.18 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  23.38 
 
 		 370 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  24.53 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  22.39 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  26.47 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.62 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  27.71 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  25.41 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  21.71 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  27.35 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  22.12 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  22.27 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  26.9 
 
 		 437 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  21.72 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  20.9 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  21.17 
 
 		 302 aa  48.9  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  22.98 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  22.05 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  19.49 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  19.2 
 
 		 380 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  20.89 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  19.2 
 
 		 380 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  20.55 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.69 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  22.63 
 
 		 409 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  24.03 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  19.14 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  21.23 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  26.06 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  20.66 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  21.71 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  20.91 
 
 		 354 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  21.97 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  21.21 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  25.93 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  22.05 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  18.25 
 
 		 302 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>