37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1256 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  100 
 
 
319 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  100 
 
 
319 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  95.92 
 
 
319 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  86.21 
 
 
319 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  68.59 
 
 
317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  64.92 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  60.39 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  60.71 
 
 
308 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  55.34 
 
 
341 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  48.4 
 
 
370 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  47.85 
 
 
320 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  40.59 
 
 
303 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  39.6 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  41.23 
 
 
307 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 
312 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 
312 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 
312 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  37.99 
 
 
300 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 
303 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  35.08 
 
 
301 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 
299 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 
305 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 
326 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  24.36 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  24.27 
 
 
323 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  28.35 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  30.42 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  31.28 
 
 
227 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.92 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  29.29 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  26.24 
 
 
304 aa  47  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  24.63 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  25.47 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>