40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2130 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  100 
 
 		 329 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  65.8 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  61.04 
 
 		 319 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  59.01 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  60.39 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  60.39 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  62.99 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  59.42 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  60.06 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  50.66 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  43.56 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  42.57 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  45.72 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  35.5 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  32.47 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  28.75 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  26.23 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  24 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  25.08 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  27.34 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  21.9 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  28.95 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  24.61 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.44 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  25.59 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  22.18 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  24.16 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  25.46 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  23.76 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  22.82 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  21.12 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>