165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0337 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  100 
 
 
257 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  45.93 
 
 
297 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  44.98 
 
 
317 aa  185  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.12 
 
 
298 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  43.69 
 
 
227 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  33.73 
 
 
305 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  32.92 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 
327 aa  142  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  33.18 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  32.54 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  27.95 
 
 
303 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 
312 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 
312 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 
307 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  27.17 
 
 
303 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  30.69 
 
 
301 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  28.35 
 
 
319 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  28.35 
 
 
319 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  27.76 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  27.76 
 
 
319 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  28.24 
 
 
317 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  27.34 
 
 
329 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 
300 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 
308 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  26.03 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  25.99 
 
 
323 aa  91.7  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 
370 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  24.8 
 
 
341 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  28.69 
 
 
320 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  20.32 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  25.12 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  27.23 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  23.76 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  23.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  23.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  23.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  23.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  23.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  23.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  23.76 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  23.76 
 
 
300 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  25.47 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  22.17 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  21.34 
 
 
327 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  24.02 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  25.49 
 
 
295 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  26.36 
 
 
302 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  21.57 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  22.01 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  25.53 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  20.09 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  24.39 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  21.55 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  26.38 
 
 
481 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  21.55 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  22.89 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  25.53 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  25.53 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  24.78 
 
 
346 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  21.55 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  24.87 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  24.87 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  21.55 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  24.12 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  21.55 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
298 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  23.85 
 
 
390 aa  53.1  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
293 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  22.7 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
333 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  29.46 
 
 
296 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  29.46 
 
 
296 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  29.46 
 
 
296 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  29.46 
 
 
296 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  21.66 
 
 
293 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  29.46 
 
 
293 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  23.16 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  20.48 
 
 
314 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.46 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.46 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.04 
 
 
388 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  22.81 
 
 
388 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  21.79 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  21.94 
 
 
354 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  22.41 
 
 
395 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
316 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  19.67 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  21.53 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  23.2 
 
 
302 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  27.23 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 
332 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  25.22 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  23.79 
 
 
460 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  21.67 
 
 
483 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>