103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1502 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 312 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  98.4 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  98.4 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  44.41 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  43.19 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 307 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  40.07 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  40.07 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  39.41 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  40.39 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  40 
 
 		 329 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  39.42 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  40.07 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  38.64 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  40.59 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  37.13 
 
 		 370 aa  201  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  30.54 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  26.79 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  32.54 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  24.2 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  27.84 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.05 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  27.96 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  24.56 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 460 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  23.55 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  21.63 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  21.61 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  21.39 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  21.53 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  23.24 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  25.6 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  26.14 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  23.31 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  18.75 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  20.71 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  19.64 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  19.69 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  22.71 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  24.24 
 
 		 483 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  23.83 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  24.78 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  19.34 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  24.13 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  19.1 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  25.15 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  22.46 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  22.68 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  20.94 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  21.77 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  21.79 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  20.99 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  22.56 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  20.57 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  24.45 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  20.29 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  22.92 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  22.48 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  21.98 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  23.46 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  24.11 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  24.55 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  21.92 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  23.46 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  23.46 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.68 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  20.29 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  19.57 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  22.12 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  22.56 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  22.46 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  21.85 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  19.64 
 
 		 474 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  21.31 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  22.49 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  19.73 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  20.34 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  21.3 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  20.22 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  20.29 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  19.1 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>