More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1954 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  63.92 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  67.27 
 
 		 294 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  61.51 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  65.41 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  66.08 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  63.96 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  65.41 
 
 		 302 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  63.16 
 
 		 292 aa  364  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  65.43 
 
 		 271 aa  358  6e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  48.1 
 
 		 293 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  45.2 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  48.54 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  43.27 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  41.24 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  43.02 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  40.77 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  37.59 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  31.14 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  31.14 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.77 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  30.51 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  32.85 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  32.59 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.14 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.14 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.49 
 
 		 299 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  31.36 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.14 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.14 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  30.95 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  30.54 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  28.94 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  25.34 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  28.12 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  28.83 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.18 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  33.57 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  28.77 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  28.77 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  28.77 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  28.42 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  28.77 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.35 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  26.25 
 
 		 398 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  28.15 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  29.27 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  28.96 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  29.64 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  29.21 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  27.04 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  26.9 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  29.64 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  29.64 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  29.17 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  27.85 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  27.36 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  28.07 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  29.29 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  28.86 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  30.31 
 
 		 305 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  27.02 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  29.6 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  26.35 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  28.22 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  28.42 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  26.95 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  26.41 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  27.57 
 
 		 317 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.99 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>