More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0947 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  52.61 
 
 
287 aa  316  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  48.36 
 
 
305 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  43.07 
 
 
292 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  39.55 
 
 
296 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
293 aa  202  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  40.82 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  43.44 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  38.61 
 
 
271 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  36.06 
 
 
289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  36.84 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
293 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
384 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 
312 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  38.24 
 
 
321 aa  192  7e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  38.66 
 
 
302 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  39.03 
 
 
302 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.08 
 
 
306 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 
352 aa  175  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  29.63 
 
 
301 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 
316 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 
294 aa  136  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  33.48 
 
 
306 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
324 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 
300 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  28.76 
 
 
317 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.24 
 
 
300 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
300 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
312 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  28.78 
 
 
313 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  26.12 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  25.7 
 
 
314 aa  119  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
325 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  27.8 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 
309 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  27.47 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  28.16 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 
366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  27.05 
 
 
314 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  26.69 
 
 
299 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 
325 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  29.9 
 
 
325 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  27.65 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  29.36 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 
309 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  27.61 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  27.01 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.91 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  27.38 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.98 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  27.98 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  27.11 
 
 
314 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  27.61 
 
 
327 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  27.98 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.98 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  26.39 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  26.39 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  26.39 
 
 
295 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  27.9 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.39 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.39 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
332 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  25.18 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  29.37 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.14 
 
 
297 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 
343 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  25.09 
 
 
305 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  29.6 
 
 
312 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  24.21 
 
 
296 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 
309 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 
302 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  27.24 
 
 
297 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 
356 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.04 
 
 
312 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  28.88 
 
 
294 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.04 
 
 
312 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.04 
 
 
312 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  27.44 
 
 
339 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
325 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>