More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2609 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 352 aa  712    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  47.27 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  46.01 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  40.83 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  44.53 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  43.54 
 
 		 321 aa  222  9e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  45.42 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  45.07 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  39.33 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  39 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  40.93 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  37.09 
 
 		 302 aa  179  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  36.09 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  35.71 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.31 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  32.34 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4987  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00631411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  28.52 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  31.28 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 300 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  28.85 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  26.41 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  30.79 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  31.92 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  33.97 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  30.15 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  34.33 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  30.2 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  34.33 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  34.33 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  33.7 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  34.33 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  33.96 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 		 325 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  30.2 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  27.31 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  30.2 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  30.93 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  28.63 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  23.62 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.91 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  33.61 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  29.28 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  29.7 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.76 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0726  cation efflux protein  35.2 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.951048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.76 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  27.69 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  29.37 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  29.37 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  29.56 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.24 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  29.39 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>