More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1408 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  100 
 
 
321 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  44.27 
 
 
365 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  46.53 
 
 
293 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  46.52 
 
 
271 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  43.19 
 
 
320 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  46.91 
 
 
294 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
296 aa  255  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
289 aa  252  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 
312 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  46.81 
 
 
302 aa  247  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.56 
 
 
293 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  43.53 
 
 
384 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  39.93 
 
 
301 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  47.33 
 
 
292 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  43.2 
 
 
302 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  43.2 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  44.06 
 
 
305 aa  229  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 
306 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  43.54 
 
 
352 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  39.27 
 
 
287 aa  203  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  38.24 
 
 
298 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  34.34 
 
 
294 aa  185  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.11 
 
 
299 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.65 
 
 
299 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  35.08 
 
 
307 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.65 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 
306 aa  169  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  32.21 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  32.3 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.7 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.65 
 
 
299 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.65 
 
 
299 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
324 aa  162  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.3 
 
 
299 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.3 
 
 
299 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 
299 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
298 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  32.45 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  32.46 
 
 
295 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 
301 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  35.61 
 
 
317 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  35.44 
 
 
327 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 
314 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  33.21 
 
 
306 aa  152  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  33.44 
 
 
312 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 
311 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
327 aa  151  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  31.19 
 
 
299 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 
325 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  31.37 
 
 
312 aa  150  4e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 
316 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 
326 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 
311 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  32.99 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  32.99 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.75 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  32.99 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  31.27 
 
 
298 aa  145  9e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 
312 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  30.72 
 
 
316 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 
316 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 
324 aa  143  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 
356 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
319 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.91 
 
 
300 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 
300 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 
313 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  29.28 
 
 
378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  31.83 
 
 
339 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  33.65 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31.83 
 
 
337 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
300 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 
332 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 
398 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 
298 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  31.97 
 
 
321 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 
336 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  32.31 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
322 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
322 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  31.33 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  31.33 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>