More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3652 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 384 aa  789    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  61.98 
 
 		 365 aa  401  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  63.91 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  63.67 
 
 		 293 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  66.55 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  60.21 
 
 		 296 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  62.37 
 
 		 302 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  62.37 
 
 		 302 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  60.28 
 
 		 292 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  61.85 
 
 		 271 aa  349  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 		 293 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  45 
 
 		 302 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  48.18 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  44.12 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  40.96 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  44.81 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  39.72 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  37.59 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  37.59 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 306 aa  166  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.55 
 
 		 299 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.57 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  32.67 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 299 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.9 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.9 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.9 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.9 
 
 		 299 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.05 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  33.09 
 
 		 295 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.55 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  33.09 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  33.82 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 294 aa  143  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  30.31 
 
 		 314 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  29.56 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  32.49 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  29.6 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 		 298 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  28.63 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 298 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  28.83 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  29.56 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  29.08 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 		 342 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  27.95 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 		 352 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 312 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  29.33 
 
 		 310 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  29.55 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  28.52 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  27.41 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  29.55 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  29.01 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.8 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  28.04 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.52 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  30.41 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  30.41 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  30.41 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  30.07 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  30.41 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  30.13 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>