More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1429 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  75.68 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  75.68 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 293 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  63.51 
 
 		 292 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  62.41 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  62.54 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  60.35 
 
 		 384 aa  362  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  62.36 
 
 		 271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  58.42 
 
 		 320 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  46.29 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  42.76 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  44.96 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  50.18 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  44.24 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  40.78 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  39.16 
 
 		 287 aa  209  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  39.55 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.77 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.78 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.82 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.82 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.07 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.82 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  32.89 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.79 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  33.21 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  28.86 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  29.07 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.45 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.45 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.45 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  28.38 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 340 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  28.77 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  28.92 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  29.05 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  31.12 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  28.63 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  29.12 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  31.29 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 398 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  25.41 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  25 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  28.82 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  28.42 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  28.62 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.93 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  29.04 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.86 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>