More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1974 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 302 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  98.34 
 
 		 302 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  75.68 
 
 		 296 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 293 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  66.32 
 
 		 365 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  64.48 
 
 		 292 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  63.29 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  61.9 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  62.41 
 
 		 294 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  62.59 
 
 		 271 aa  351  7e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 293 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  45.94 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  48.56 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  44.4 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  42.55 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  48.75 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  45.72 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  39.93 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  37.76 
 
 		 287 aa  205  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  39.03 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.21 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.88 
 
 		 299 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.88 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.88 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.88 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.88 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.22 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.22 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.41 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.93 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.42 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.88 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 314 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 		 327 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  30.34 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.33 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.67 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 319 aa  138  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 319 aa  138  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  31.13 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  31.12 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  31.01 
 
 		 378 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  29.55 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.21 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  30.17 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  30.21 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.21 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  30 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  25.33 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  31 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 		 398 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  31 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  31 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  30.67 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  31 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.14 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  30.67 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  29.83 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  29.45 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  29.02 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  30.87 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  28.85 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  27.49 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>