More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1967 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 365 aa  743    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  68.9 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  66.11 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  66.11 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  59.8 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  61.64 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  67.04 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 		 292 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  49.45 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  49.65 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  47.27 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  45.2 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  49.27 
 
 		 306 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  45.21 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  41.88 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  41.45 
 
 		 287 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  43.44 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  31.89 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 		 299 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  31.89 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.01 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.89 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.89 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.56 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.56 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  28.48 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  31.77 
 
 		 295 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.56 
 
 		 299 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 		 325 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  30.35 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.45 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.69 
 
 		 304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  32.15 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  27.25 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  29.59 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.64 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.43 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.43 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.43 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.02 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  30.21 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.93 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  26.82 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  30.12 
 
 		 342 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  29.93 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 359 aa  135  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  29.56 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  29.7 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  29.7 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  30.41 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  31.12 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  30.12 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  29.49 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  28.81 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  28.47 
 
 		 294 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  28.28 
 
 		 298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  30.03 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  25.8 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  30.06 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  27.05 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  26.14 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>