More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1715 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  100 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  47.84 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  48.36 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 		 365 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  45.05 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  42.66 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  39.53 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  46.28 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  46.05 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  34.07 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  37.87 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  31.66 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  31.8 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  30.77 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  30.77 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  31.5 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  31.5 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  30.59 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  32.24 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  32 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  32 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  30.97 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  32 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  32.71 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  29.72 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.83 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  31.58 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  27.47 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  24.47 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.07 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 373 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.42 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  32.92 
 
 		 378 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  30.25 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  33.82 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  30.92 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  27.3 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  30.42 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.95 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  30.07 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  30.07 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  28.05 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  30.38 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  31.03 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  32.02 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  32.92 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  32.92 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  30.19 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  32.72 
 
 		 352 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  32.68 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  32.68 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  30.36 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  28.62 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  30.62 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.01 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  29.27 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  33.47 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>