More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2027 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  80.74 
 
 		 271 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.9 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  65.05 
 
 		 365 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  65.72 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  61.86 
 
 		 296 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  62.16 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  61.17 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  61.82 
 
 		 302 aa  359  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  62.5 
 
 		 292 aa  353  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  48.97 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  45.91 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  46.91 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  46.62 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  47.45 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  41.33 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  44.62 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  42.22 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  40.94 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  39.78 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.9 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.25 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.23 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.68 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  36.73 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.53 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.53 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.88 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.53 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.03 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  32.53 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.06 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.61 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 317 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.33 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.33 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.33 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.19 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.95 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  32.74 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  29.86 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  30.61 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  30.82 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  30.21 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  32 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  30.51 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.59 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  32.43 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  30.1 
 
 		 299 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  30.43 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  30.04 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  31.12 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 372 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  32.78 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  32.43 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  28.19 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  28.62 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  31.31 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  29.82 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  29.83 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 356 aa  128  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  30.38 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>