More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02030 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  80.74 
 
 		 294 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  67.04 
 
 		 365 aa  364  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 293 aa  358  6e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  62.36 
 
 		 296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  61.85 
 
 		 384 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  60.45 
 
 		 320 aa  338  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  62.17 
 
 		 292 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  62.59 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  62.59 
 
 		 302 aa  335  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  50.37 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  46.52 
 
 		 321 aa  265  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  46.82 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  45.15 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 		 306 aa  227  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  40.84 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  40.91 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  40.93 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  46.05 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  39.85 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  38.61 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.83 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.42 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.43 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.06 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.06 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.7 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.7 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.33 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.93 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.08 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  34.31 
 
 		 312 aa  158  8e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.06 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 325 aa  148  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 398 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.11 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.11 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.11 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  31.75 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  28.3 
 
 		 317 aa  138  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  30.55 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  31.7 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  29.93 
 
 		 314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  30.8 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 359 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  30.58 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  29.93 
 
 		 378 aa  131  9e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  28.84 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  31.72 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  27.92 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.89 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  31.15 
 
 		 315 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 		 307 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  29.04 
 
 		 303 aa  128  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 311 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  33.33 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  30.8 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  27.74 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  30.74 
 
 		 316 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  28.94 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  31.25 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 		 342 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  30.88 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.62 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  30.77 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  27.44 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>