More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3463 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
293 aa  587  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  50.36 
 
 
312 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  50.91 
 
 
294 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  50.37 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
293 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 
296 aa  279  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  49.45 
 
 
365 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  49.82 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 
302 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  47.33 
 
 
321 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  51.44 
 
 
302 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  47.25 
 
 
320 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  45.86 
 
 
292 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  43.07 
 
 
289 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  48.91 
 
 
306 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  42.96 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  45.69 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  38.58 
 
 
298 aa  196  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  36.56 
 
 
287 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  38.38 
 
 
305 aa  192  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
306 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.13 
 
 
299 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  29.6 
 
 
324 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.69 
 
 
299 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 
299 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.69 
 
 
299 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  35.5 
 
 
325 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  28.92 
 
 
294 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.7 
 
 
298 aa  148  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.7 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.33 
 
 
295 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.21 
 
 
299 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.33 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.33 
 
 
299 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.33 
 
 
299 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 
300 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 
327 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 
314 aa  142  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  31.82 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.49 
 
 
298 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 
316 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.84 
 
 
306 aa  138  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 
343 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  30.15 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  27.92 
 
 
298 aa  133  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  32.98 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
326 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
325 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
325 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
315 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
300 aa  132  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  29.93 
 
 
297 aa  132  9e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  28.57 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  30.93 
 
 
314 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
291 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  32.72 
 
 
319 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  32.72 
 
 
319 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 
336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.56 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  30.21 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  30.91 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
327 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  31.98 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 
333 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  30.9 
 
 
312 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  31.1 
 
 
299 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  27.7 
 
 
313 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 
366 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1433  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
306 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
305 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  28.88 
 
 
312 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
352 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  28.88 
 
 
312 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  28.88 
 
 
312 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  32.01 
 
 
325 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  32.01 
 
 
325 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  30.29 
 
 
316 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  30 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  29.51 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  24.13 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  31.23 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 
305 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
322 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
312 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
322 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 
305 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>