More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3267 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  100 
 
 
301 aa  609  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
296 aa  252  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  43.07 
 
 
320 aa  242  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  40.28 
 
 
321 aa  240  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 
384 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  41.33 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0231  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 
302 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 
365 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1974  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 
302 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0468  cation efflux protein  40.36 
 
 
302 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 
312 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  40.91 
 
 
271 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00375  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 
292 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2609  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 
352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2198  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 
306 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1701  cation diffusion facilitator family transporter  37.73 
 
 
289 aa  208  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0430  cation efflux system protein  34.69 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  34.07 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 
311 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
294 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.63 
 
 
299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.28 
 
 
299 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.21 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.21 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  33.21 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.21 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0947  Co/Zn/Cd efflux system component  29.63 
 
 
298 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  31.93 
 
 
299 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.85 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 
299 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.64 
 
 
304 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  32.83 
 
 
299 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  34.42 
 
 
326 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
324 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  33.45 
 
 
299 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 
306 aa  158  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 
298 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  31 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  34.63 
 
 
317 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.17 
 
 
298 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 
307 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 
317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 
321 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 
321 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.91 
 
 
311 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.59 
 
 
327 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 
317 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
298 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
327 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.33 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  34.63 
 
 
306 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 
342 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  31.08 
 
 
313 aa  145  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 
316 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 
298 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  37.91 
 
 
316 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 
284 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  33.1 
 
 
299 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  31.02 
 
 
312 aa  144  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.37 
 
 
297 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 
342 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  33.09 
 
 
378 aa  144  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  32.37 
 
 
297 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  31.4 
 
 
331 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  32.42 
 
 
305 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 
342 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 
284 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 
315 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  30.96 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 
300 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  31.84 
 
 
294 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 
342 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.39 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  32.39 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 
301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  28.88 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  32.63 
 
 
312 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  30.94 
 
 
306 aa  139  6e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  32.63 
 
 
312 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
343 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  32.63 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 
326 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 
300 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>