45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2938 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
308 aa  613  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  64.82 
 
 
319 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  65.8 
 
 
329 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  65.15 
 
 
319 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  64.92 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  64.92 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  61.56 
 
 
341 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  61.89 
 
 
317 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  65.47 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  53.27 
 
 
370 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  43.09 
 
 
303 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  49.01 
 
 
320 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  42.11 
 
 
303 aa  265  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
312 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
312 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
312 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  41.56 
 
 
307 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 
300 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 
303 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  33.44 
 
 
301 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 
305 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 
327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 
299 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 
326 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  26.35 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  25.41 
 
 
323 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  28.85 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  26.03 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.93 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  29.84 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  26.19 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.52 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  27.39 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  24.08 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  24.37 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  25.48 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  31.13 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  21.7 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0153  cation diffusion facilitator family transporter  29.77 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0646969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  23.7 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.94 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>