222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1039 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  52.2 
 
 		 652 aa  673    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  49.85 
 
 		 644 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 653 aa  1363    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  52.43 
 
 		 650 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 653 aa  1363    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  48.59 
 
 		 662 aa  617  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  49.77 
 
 		 646 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  48.78 
 
 		 644 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  49.16 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  47.79 
 
 		 644 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  31.94 
 
 		 693 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  31.25 
 
 		 726 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  31.39 
 
 		 726 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  31.39 
 
 		 726 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  30.9 
 
 		 567 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  28.69 
 
 		 704 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  32.47 
 
 		 422 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  30.27 
 
 		 377 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 154 aa  98.6  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  27.76 
 
 		 361 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  24.76 
 
 		 866 aa  73.9  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  23.89 
 
 		 866 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  25.46 
 
 		 912 aa  71.6  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  24.92 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  24.92 
 
 		 913 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  24.52 
 
 		 939 aa  70.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  22.13 
 
 		 896 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  22.97 
 
 		 886 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  21.65 
 
 		 896 aa  68.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  24.91 
 
 		 930 aa  68.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  24.18 
 
 		 906 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  24.08 
 
 		 925 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  21.64 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  25.97 
 
 		 929 aa  65.1  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  25.33 
 
 		 930 aa  64.7  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  21.15 
 
 		 953 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  26.92 
 
 		 931 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  24.73 
 
 		 938 aa  64.3  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  22.83 
 
 		 866 aa  63.9  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  23.85 
 
 		 946 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  21.27 
 
 		 911 aa  63.2  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  25.61 
 
 		 953 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  21.78 
 
 		 897 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1873  DNA-directed DNA polymerase  24.38 
 
 		 755 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000393429  normal  0.0429969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  22.98 
 
 		 892 aa  62.4  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  22.38 
 
 		 915 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  22.86 
 
 		 915 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  23.16 
 
 		 879 aa  62  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  21.72 
 
 		 926 aa  61.6  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  22.75 
 
 		 892 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  24 
 
 		 928 aa  60.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  24.41 
 
 		 878 aa  60.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  24.8 
 
 		 1047 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  21.96 
 
 		 915 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  21.85 
 
 		 1000 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  24.12 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  28.38 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  27.52 
 
 		 928 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  21.5 
 
 		 916 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  25.35 
 
 		 923 aa  60.1  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  22.06 
 
 		 932 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  21.96 
 
 		 915 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  21.65 
 
 		 905 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  22.14 
 
 		 845 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  22.59 
 
 		 911 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  21.95 
 
 		 908 aa  59.3  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  21.59 
 
 		 934 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  22.87 
 
 		 907 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 935 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  23.98 
 
 		 937 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  23.08 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  21.96 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  24.39 
 
 		 911 aa  57.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  23.48 
 
 		 976 aa  57.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  22.89 
 
 		 899 aa  57.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  22.49 
 
 		 1024 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  24.29 
 
 		 979 aa  57  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  23.74 
 
 		 907 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  23.29 
 
 		 899 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  22.58 
 
 		 898 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  25.83 
 
 		 979 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  24.29 
 
 		 978 aa  57  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  21.37 
 
 		 891 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  24.65 
 
 		 922 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  24.39 
 
 		 1047 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  24.39 
 
 		 1047 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  24.05 
 
 		 968 aa  56.2  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  24.4 
 
 		 947 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  23.19 
 
 		 896 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  23.89 
 
 		 934 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  21.07 
 
 		 929 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  21.2 
 
 		 932 aa  55.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  22.77 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  23.61 
 
 		 928 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  22.76 
 
 		 891 aa  54.7  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  24.65 
 
 		 933 aa  54.7  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  21.24 
 
 		 931 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  22.8 
 
 		 918 aa  54.3  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  23.85 
 
 		 942 aa  54.3  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  20.95 
 
 		 894 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>