50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1176 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  94.35 
 
 		 377 aa  648    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 422 aa  827    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  51.99 
 
 		 693 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 726 aa  1490    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 567 aa  1159    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  94.9 
 
 		 726 aa  1353    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  94.9 
 
 		 726 aa  1353    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  42.28 
 
 		 704 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 650 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  32.79 
 
 		 652 aa  346  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  32.2 
 
 		 653 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  32.2 
 
 		 653 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  31.78 
 
 		 644 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 		 644 aa  317  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  31.39 
 
 		 646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  30.48 
 
 		 662 aa  295  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  31.16 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  30.61 
 
 		 644 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  96.1 
 
 		 154 aa  277  6e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  26.33 
 
 		 361 aa  77  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  23.72 
 
 		 897 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  23.72 
 
 		 897 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  23.4 
 
 		 897 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  20.89 
 
 		 915 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  27.73 
 
 		 913 aa  50.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 923 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 908 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 923 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 923 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  23.4 
 
 		 899 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  27.56 
 
 		 913 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  20.89 
 
 		 926 aa  48.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  27.56 
 
 		 582 aa  48.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  21.09 
 
 		 917 aa  47.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  21.09 
 
 		 917 aa  47.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  21.09 
 
 		 917 aa  47.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  20.95 
 
 		 917 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  21.64 
 
 		 939 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 917 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 907 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  24.48 
 
 		 922 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  24.48 
 
 		 922 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 946 aa  44.3  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 903 aa  43.9  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>