58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3411 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 704 aa  1451    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  44.74 
 
 		 693 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  42.41 
 
 		 726 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  42.41 
 
 		 726 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  42.28 
 
 		 726 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  40.1 
 
 		 567 aa  334  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  31.35 
 
 		 650 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  30.78 
 
 		 652 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  29.4 
 
 		 644 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  29.07 
 
 		 644 aa  265  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  29.31 
 
 		 647 aa  263  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  30.28 
 
 		 646 aa  256  8e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  29.11 
 
 		 644 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  27.63 
 
 		 662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  28.69 
 
 		 653 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  28.69 
 
 		 653 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  47.35 
 
 		 377 aa  220  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  39.15 
 
 		 422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  42.33 
 
 		 154 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  25.57 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 884 aa  54.3  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30.77 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 940 aa  48.9  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 936 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 		 682 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  30.25 
 
 		 931 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 926 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 926 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 923 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 923 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 926 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 926 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 923 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 926 aa  47.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  31.2 
 
 		 921 aa  47.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  41.1 
 
 		 1273 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 913 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 915 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  22.54 
 
 		 875 aa  46.6  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  35.21 
 
 		 917 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 843 aa  45.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 917 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 917 aa  45.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  45.45 
 
 		 872 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 917 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 917 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  25.48 
 
 		 940 aa  44.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  31.88 
 
 		 904 aa  44.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  26.82 
 
 		 937 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 917 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 917 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  26.82 
 
 		 937 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  30.63 
 
 		 845 aa  44.3  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 941 aa  44.3  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  35.62 
 
 		 912 aa  44.3  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  25.38 
 
 		 972 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  25.21 
 
 		 932 aa  43.9  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>