More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1059 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  50.11 
 
 		 861 aa  811    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  100 
 
 		 921 aa  1882    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  55.46 
 
 		 931 aa  976    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  58.66 
 
 		 872 aa  1023    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2445  DNA polymerase I  61.57 
 
 		 1015 aa  670    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 892 aa  520  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  53.71 
 
 		 845 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 888 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  35.15 
 
 		 946 aa  502  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  35.31 
 
 		 903 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 976 aa  482  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 936 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 901 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 885 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  31.32 
 
 		 898 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  33.4 
 
 		 930 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 850 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  32.28 
 
 		 926 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  34.69 
 
 		 924 aa  459  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  31.14 
 
 		 956 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  33.79 
 
 		 930 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  35.05 
 
 		 908 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 912 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 855 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  32.58 
 
 		 946 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 893 aa  445  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 884 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  33.4 
 
 		 933 aa  442  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  32.55 
 
 		 953 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  31.18 
 
 		 896 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  34.36 
 
 		 905 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  34.09 
 
 		 875 aa  432  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  33.98 
 
 		 866 aa  428  1e-118  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  33.02 
 
 		 955 aa  426  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  30.95 
 
 		 972 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  30.95 
 
 		 972 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  32.98 
 
 		 889 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  31.83 
 
 		 966 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 929 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  32.66 
 
 		 894 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  34.34 
 
 		 917 aa  416  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  32.4 
 
 		 885 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  33.16 
 
 		 888 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  33.19 
 
 		 901 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 836 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  30.86 
 
 		 976 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  47.66 
 
 		 891 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  45.3 
 
 		 929 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  30.78 
 
 		 977 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 888 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  30.65 
 
 		 982 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  44.06 
 
 		 892 aa  386  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  46.59 
 
 		 903 aa  382  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  44.79 
 
 		 878 aa  381  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  48.19 
 
 		 910 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  43.69 
 
 		 892 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  43.02 
 
 		 868 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  43.2 
 
 		 891 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.86 
 
 		 892 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  42.41 
 
 		 870 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  46.48 
 
 		 903 aa  379  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  47.44 
 
 		 904 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  47.22 
 
 		 937 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  46.85 
 
 		 911 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  45.67 
 
 		 926 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  41.72 
 
 		 876 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  46.75 
 
 		 902 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  46.12 
 
 		 941 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  44.99 
 
 		 903 aa  373  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  48.36 
 
 		 897 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  46.5 
 
 		 924 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  46.75 
 
 		 902 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  44.11 
 
 		 902 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  47.12 
 
 		 937 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  45.69 
 
 		 928 aa  369  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  45.69 
 
 		 906 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  45.78 
 
 		 917 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  45.82 
 
 		 876 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  46.51 
 
 		 926 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  47.9 
 
 		 897 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  46.64 
 
 		 928 aa  369  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  45.52 
 
 		 934 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  45.36 
 
 		 907 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  44.28 
 
 		 878 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  46.51 
 
 		 917 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  44.42 
 
 		 928 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  46.51 
 
 		 917 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  43.61 
 
 		 883 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  45.82 
 
 		 876 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  46.51 
 
 		 917 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  47.9 
 
 		 897 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  41.51 
 
 		 878 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 872 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  45.92 
 
 		 913 aa  365  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  41.77 
 
 		 877 aa  365  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  45.26 
 
 		 929 aa  365  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  46.27 
 
 		 917 aa  365  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  45.78 
 
 		 917 aa  365  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 895 aa  364  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  46.39 
 
 		 917 aa  364  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>