More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3201 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  67.81 
 
 
911 aa  1197    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  60.78 
 
 
905 aa  1031    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  57.11 
 
 
928 aa  971    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  62.13 
 
 
899 aa  1055    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  51.05 
 
 
894 aa  855    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  62.57 
 
 
920 aa  1110    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  64.91 
 
 
888 aa  1068    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  59.45 
 
 
901 aa  994    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  100 
 
 
912 aa  1833    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  49.15 
 
 
937 aa  792    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  58.27 
 
 
929 aa  974    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  62.9 
 
 
929 aa  1102    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  57.49 
 
 
908 aa  952    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  60.74 
 
 
910 aa  1048    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  61.9 
 
 
899 aa  1048    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  62.78 
 
 
902 aa  1073    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  62.42 
 
 
909 aa  1127    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  60.72 
 
 
917 aa  1054    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  60.59 
 
 
893 aa  1039    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  42.18 
 
 
955 aa  669    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  67.08 
 
 
945 aa  1148    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  62.02 
 
 
908 aa  1109    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  61.59 
 
 
949 aa  1090    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  49.56 
 
 
904 aa  763    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  63.77 
 
 
933 aa  1133    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  62.24 
 
 
906 aa  1105    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  62.57 
 
 
920 aa  1110    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  58.48 
 
 
901 aa  985    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  63.02 
 
 
901 aa  1106    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  61.95 
 
 
904 aa  1055    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  60.87 
 
 
908 aa  1007    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  55.78 
 
 
893 aa  966    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  51.97 
 
 
955 aa  874    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  66.22 
 
 
910 aa  1116    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  58.51 
 
 
904 aa  894    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  64.13 
 
 
889 aa  1104    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  59.65 
 
 
905 aa  948    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  39.38 
 
 
878 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  37.18 
 
 
872 aa  628  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  38.84 
 
 
870 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  40.24 
 
 
876 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.89 
 
 
877 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  38.37 
 
 
877 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  37.78 
 
 
891 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  37.78 
 
 
891 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  37.78 
 
 
891 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  37.78 
 
 
877 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  37.78 
 
 
877 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  37.78 
 
 
877 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  37.67 
 
 
877 aa  602  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  37.9 
 
 
877 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.83 
 
 
877 aa  602  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  36.87 
 
 
883 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  36.23 
 
 
894 aa  598  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.07 
 
 
895 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40 
 
 
891 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  40.51 
 
 
878 aa  595  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  36.71 
 
 
876 aa  592  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  38.73 
 
 
866 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  36.71 
 
 
876 aa  592  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  40.33 
 
 
888 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.6 
 
 
891 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.13 
 
 
892 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  41.48 
 
 
899 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.7 
 
 
906 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37.06 
 
 
939 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  34.77 
 
 
866 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  34.73 
 
 
866 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.3 
 
 
876 aa  575  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.84 
 
 
903 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  39.46 
 
 
904 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.85 
 
 
892 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.08 
 
 
903 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37.74 
 
 
868 aa  572  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.85 
 
 
892 aa  572  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  40.85 
 
 
897 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  36.97 
 
 
956 aa  571  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.42 
 
 
930 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  39.32 
 
 
892 aa  568  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  36.41 
 
 
850 aa  569  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.54 
 
 
912 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.68 
 
 
893 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  40.2 
 
 
897 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  35.91 
 
 
946 aa  560  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  35.97 
 
 
888 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  35.72 
 
 
896 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  37.75 
 
 
902 aa  562  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  39.98 
 
 
897 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37.64 
 
 
902 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  39.14 
 
 
885 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  36.33 
 
 
877 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  37.54 
 
 
879 aa  558  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  38.22 
 
 
873 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  39.3 
 
 
911 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  38.57 
 
 
905 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.21 
 
 
940 aa  552  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  34.56 
 
 
896 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.23 
 
 
892 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.01 
 
 
902 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  37.14 
 
 
893 aa  548  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>