More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5532 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  56.5 
 
 		 928 aa  922    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  64.46 
 
 		 917 aa  1088    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  58.24 
 
 		 893 aa  969    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  59.71 
 
 		 901 aa  986    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  62.63 
 
 		 910 aa  1065    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  54.85 
 
 		 893 aa  939    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  60.4 
 
 		 908 aa  1011    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  64.32 
 
 		 949 aa  1127    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  50.69 
 
 		 937 aa  812    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  62.06 
 
 		 904 aa  983    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  52.3 
 
 		 894 aa  861    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  58.59 
 
 		 929 aa  950    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  61.8 
 
 		 902 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  61 
 
 		 899 aa  1056    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  61.23 
 
 		 905 aa  979    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  62.72 
 
 		 933 aa  1070    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 878 aa  646    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  67.42 
 
 		 908 aa  1194    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  65.18 
 
 		 929 aa  1151    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  67.34 
 
 		 901 aa  1178    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  61.14 
 
 		 945 aa  1023    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  61.33 
 
 		 899 aa  1057    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  67 
 
 		 909 aa  1199    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  61.37 
 
 		 906 aa  1043    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  58.76 
 
 		 905 aa  964    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  42.17 
 
 		 895 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  67.49 
 
 		 904 aa  1130    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  60.65 
 
 		 911 aa  1054    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  65.95 
 
 		 920 aa  1159    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  60.53 
 
 		 908 aa  1004    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  48.52 
 
 		 904 aa  769    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  51.72 
 
 		 955 aa  868    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  62.85 
 
 		 910 aa  1028    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  58.63 
 
 		 901 aa  972    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  100 
 
 		 888 aa  1785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  64.91 
 
 		 912 aa  1094    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  62.92 
 
 		 889 aa  1060    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  44.79 
 
 		 955 aa  697    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  65.95 
 
 		 920 aa  1159    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 877 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 891 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 891 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 891 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 877 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 877 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 877 aa  625  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 877 aa  625  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 877 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 877 aa  622  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  40 
 
 		 877 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  41.74 
 
 		 876 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 883 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 872 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 870 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 899 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 891 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.39 
 
 		 903 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 888 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 866 aa  594  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 873 aa  594  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 903 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  39.51 
 
 		 868 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 885 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  41.4 
 
 		 897 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 906 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  36.13 
 
 		 866 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 866 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 904 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  41.39 
 
 		 897 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 912 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 897 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 894 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 876 aa  572  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 939 aa  572  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 956 aa  569  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  38.02 
 
 		 877 aa  568  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 902 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  39.82 
 
 		 911 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 934 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.46 
 
 		 905 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 902 aa  565  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 879 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 940 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  40.13 
 
 		 878 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.66 
 
 		 888 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  37.43 
 
 		 880 aa  560  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 930 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 850 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 888 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  36.35 
 
 		 896 aa  558  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  36.72 
 
 		 928 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.6 
 
 		 891 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 930 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  36.94 
 
 		 903 aa  550  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 926 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  37.89 
 
 		 928 aa  549  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 951 aa  550  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 930 aa  549  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>