More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1441 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  42.79 
 
 
878 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  43.2 
 
 
877 aa  693    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.25 
 
 
903 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.66 
 
 
891 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  43.29 
 
 
876 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  40.58 
 
 
903 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  40.02 
 
 
903 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  43.08 
 
 
877 aa  691    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  43.2 
 
 
891 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  43.2 
 
 
891 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  42.42 
 
 
877 aa  677    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  43.2 
 
 
891 aa  693    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  45.61 
 
 
870 aa  710    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  42.97 
 
 
895 aa  703    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  43.81 
 
 
876 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  47.03 
 
 
894 aa  771    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.82 
 
 
891 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  46.57 
 
 
896 aa  732    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  43.2 
 
 
877 aa  693    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  43.12 
 
 
877 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  44.58 
 
 
872 aa  703    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.59 
 
 
885 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  43.81 
 
 
876 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  100 
 
 
850 aa  1721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  44.53 
 
 
883 aa  741    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  42.32 
 
 
868 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  42.49 
 
 
877 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  45.37 
 
 
866 aa  703    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  45.3 
 
 
866 aa  701    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  44.1 
 
 
878 aa  720    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  42.4 
 
 
866 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  43.2 
 
 
877 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  43.23 
 
 
877 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  42.78 
 
 
896 aa  659    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  44.98 
 
 
888 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  41.26 
 
 
873 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40.55 
 
 
893 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  40.88 
 
 
879 aa  647    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  42.69 
 
 
855 aa  633  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.14 
 
 
892 aa  634  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  38.37 
 
 
885 aa  630  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  41.85 
 
 
888 aa  630  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  41.41 
 
 
877 aa  628  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.99 
 
 
903 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.11 
 
 
892 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  39.75 
 
 
875 aa  620  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  39.84 
 
 
878 aa  618  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  39.01 
 
 
912 aa  617  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.49 
 
 
892 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  42.7 
 
 
879 aa  610  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  38.88 
 
 
921 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.39 
 
 
893 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.34 
 
 
893 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.85 
 
 
912 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.47 
 
 
902 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  42.92 
 
 
880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  39.76 
 
 
903 aa  604  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  40.65 
 
 
890 aa  599  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  38.86 
 
 
925 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  39.27 
 
 
935 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  36.42 
 
 
935 aa  602  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  41.39 
 
 
898 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  38.73 
 
 
906 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.55 
 
 
903 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  38.56 
 
 
908 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  37.55 
 
 
928 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  41.14 
 
 
893 aa  595  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  39.37 
 
 
915 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  36.91 
 
 
926 aa  589  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.89 
 
 
901 aa  592  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  38.85 
 
 
913 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  39.16 
 
 
915 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  38.68 
 
 
917 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  37.92 
 
 
928 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  37.35 
 
 
932 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  39.45 
 
 
902 aa  586  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.01 
 
 
892 aa  588  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.14 
 
 
892 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.56 
 
 
888 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  38.56 
 
 
915 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  35.75 
 
 
897 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  39.45 
 
 
902 aa  585  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  37.6 
 
 
920 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  37.6 
 
 
920 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  38.46 
 
 
915 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  37.47 
 
 
929 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.14 
 
 
929 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  35.51 
 
 
897 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  35.51 
 
 
897 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.56 
 
 
929 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.92 
 
 
934 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  38.07 
 
 
908 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.18 
 
 
908 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  38.11 
 
 
930 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  40.51 
 
 
843 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.56 
 
 
909 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  35.82 
 
 
899 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  38.04 
 
 
931 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  39.19 
 
 
862 aa  570  1e-161  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  36.62 
 
 
932 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>