More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0536 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.92 
 
 
928 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.92 
 
 
928 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  40.95 
 
 
902 aa  652    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.49 
 
 
891 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.92 
 
 
928 aa  659    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  40.86 
 
 
926 aa  676    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  43.43 
 
 
893 aa  721    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.87 
 
 
906 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  38.26 
 
 
946 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.11 
 
 
892 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  38.75 
 
 
936 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  40.04 
 
 
933 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  40.63 
 
 
979 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  39.83 
 
 
922 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  60.98 
 
 
950 aa  1165    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  43.32 
 
 
893 aa  721    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  39.62 
 
 
949 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  40.57 
 
 
928 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  39.34 
 
 
926 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  42.04 
 
 
896 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  42.2 
 
 
896 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  40.36 
 
 
935 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  60.04 
 
 
936 aa  1139    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  40.3 
 
 
930 aa  681    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  40.99 
 
 
888 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.02 
 
 
922 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.41 
 
 
941 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  40.26 
 
 
921 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  38.87 
 
 
937 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  68.7 
 
 
943 aa  1328    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  40.77 
 
 
978 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  39.35 
 
 
923 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  41.61 
 
 
903 aa  685    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  39.66 
 
 
1000 aa  636    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  41.38 
 
 
937 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  43.52 
 
 
891 aa  735    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  40.19 
 
 
945 aa  651    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  62.8 
 
 
945 aa  1219    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  39.35 
 
 
923 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  59.42 
 
 
924 aa  1122    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  39.34 
 
 
926 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  42.46 
 
 
892 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  39.34 
 
 
926 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.87 
 
 
939 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.55 
 
 
934 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  39.72 
 
 
932 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  38.88 
 
 
898 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  40.28 
 
 
905 aa  652    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.81 
 
 
928 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  39.61 
 
 
926 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  40.95 
 
 
902 aa  652    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  39.6 
 
 
942 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.17 
 
 
918 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  39.72 
 
 
932 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.04 
 
 
926 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.68 
 
 
928 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  40.04 
 
 
976 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  39.72 
 
 
932 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.57 
 
 
928 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  39.66 
 
 
928 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  40.24 
 
 
890 aa  653    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  39.46 
 
 
915 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  39.92 
 
 
934 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  40.26 
 
 
921 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  41.76 
 
 
935 aa  662    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.47 
 
 
945 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.92 
 
 
928 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  39.34 
 
 
926 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.64 
 
 
928 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  66.31 
 
 
944 aa  1266    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  40.5 
 
 
946 aa  692    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  39.46 
 
 
923 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.1 
 
 
951 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  39.57 
 
 
922 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  39.68 
 
 
922 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.06 
 
 
912 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  39.81 
 
 
918 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.53 
 
 
892 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  40.96 
 
 
928 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  40.32 
 
 
936 aa  687    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  40.57 
 
 
928 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  40.66 
 
 
979 aa  660    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  42.02 
 
 
924 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  39.85 
 
 
930 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  40.36 
 
 
928 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  39.81 
 
 
943 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.77 
 
 
930 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.92 
 
 
928 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  42.17 
 
 
902 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  40.6 
 
 
911 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40.09 
 
 
922 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.92 
 
 
928 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.52 
 
 
893 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  100 
 
 
946 aa  1942    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  39.18 
 
 
933 aa  641    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  40.41 
 
 
908 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.81 
 
 
923 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.39 
 
 
904 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  41.32 
 
 
892 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  41.59 
 
 
937 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>