More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1403 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  46.08 
 
 		 870 aa  755    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  43.9 
 
 		 878 aa  718    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  43.99 
 
 		 891 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 876 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  42.49 
 
 		 877 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  42.6 
 
 		 877 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  47.29 
 
 		 895 aa  731    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 891 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  42.6 
 
 		 891 aa  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 877 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  42.6 
 
 		 891 aa  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  43.89 
 
 		 877 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  46.12 
 
 		 872 aa  737    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  44.01 
 
 		 876 aa  690    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  42.11 
 
 		 893 aa  642    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  43.53 
 
 		 892 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  42.32 
 
 		 893 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  42.33 
 
 		 875 aa  637    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  44.56 
 
 		 891 aa  715    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 876 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  44.24 
 
 		 894 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  44.64 
 
 		 892 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 877 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  44.88 
 
 		 896 aa  733    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  43.92 
 
 		 850 aa  724    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  50.9 
 
 		 885 aa  786    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  43.04 
 
 		 885 aa  648    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  52.79 
 
 		 888 aa  879    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  44.19 
 
 		 873 aa  688    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  100 
 
 		 878 aa  1775    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 855 aa  643    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  42.6 
 
 		 877 aa  702    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 892 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  43.09 
 
 		 866 aa  725    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  43.38 
 
 		 866 aa  727    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.38 
 
 		 888 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  46.22 
 
 		 866 aa  739    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  54.1 
 
 		 883 aa  923    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  42.49 
 
 		 877 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 896 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.33 
 
 		 892 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  42.94 
 
 		 877 aa  707    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  50.4 
 
 		 868 aa  810    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 876 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 892 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 888 aa  628  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  41.23 
 
 		 930 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.09 
 
 		 903 aa  622  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  40.2 
 
 		 903 aa  621  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 879 aa  620  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  42.57 
 
 		 902 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 878 aa  616  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 879 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  39.82 
 
 		 903 aa  611  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  42.69 
 
 		 924 aa  611  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 893 aa  611  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 932 aa  607  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.22 
 
 		 903 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  40.62 
 
 		 936 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  39.73 
 
 		 877 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  41.29 
 
 		 906 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 911 aa  601  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 898 aa  599  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 880 aa  598  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  40.34 
 
 		 935 aa  597  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.3 
 
 		 946 aa  596  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 912 aa  594  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 908 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 928 aa  595  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 912 aa  594  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 893 aa  595  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 893 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 903 aa  592  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 909 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 956 aa  587  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  39.73 
 
 		 901 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 912 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  41.19 
 
 		 906 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 932 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 920 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 939 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 915 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.11 
 
 		 939 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.68 
 
 		 926 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 920 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  36.72 
 
 		 926 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 915 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  39.47 
 
 		 929 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.64 
 
 		 930 aa  582  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 928 aa  581  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.7 
 
 		 915 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 936 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 931 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  39 
 
 		 946 aa  582  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 915 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  40.26 
 
 		 926 aa  578  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 929 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 904 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 897 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>