More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1713 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  64.57 
 
 		 931 aa  1101    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  53.42 
 
 		 861 aa  858    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  54.02 
 
 		 845 aa  883    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  58.66 
 
 		 921 aa  1024    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  100 
 
 		 872 aa  1770    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2445  DNA polymerase I  74.91 
 
 		 1015 aa  855    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 892 aa  549  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 892 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 892 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.39 
 
 		 902 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 895 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 891 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 892 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 944 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 897 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  36.07 
 
 		 903 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37.97 
 
 		 868 aa  509  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 897 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  35.1 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  35.57 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 891 aa  505  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  34.93 
 
 		 896 aa  504  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 888 aa  505  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.3 
 
 		 912 aa  505  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  35.7 
 
 		 943 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  35.39 
 
 		 928 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.73 
 
 		 929 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  38.21 
 
 		 897 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  35.62 
 
 		 929 aa  499  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  32.44 
 
 		 898 aa  498  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.61 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 901 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 932 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 870 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 932 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 932 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 908 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 872 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 928 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  34.47 
 
 		 893 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 936 aa  490  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  34.74 
 
 		 893 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 876 aa  492  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 902 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 876 aa  492  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 893 aa  492  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 902 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 877 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 855 aa  488  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 891 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 891 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 891 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 888 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  35.05 
 
 		 877 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 877 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 877 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 937 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 936 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 877 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 877 aa  488  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 877 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 878 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  33.52 
 
 		 890 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  35.22 
 
 		 950 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 928 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 846 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 928 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 928 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 843 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 928 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 877 aa  482  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  35.85 
 
 		 915 aa  479  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 892 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 907 aa  476  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  34.01 
 
 		 876 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  35.05 
 
 		 930 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 878 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  31.94 
 
 		 850 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 930 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  34.43 
 
 		 862 aa  472  1.0000000000000001e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  36.38 
 
 		 928 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 884 aa  471  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  32.3 
 
 		 894 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 873 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  34.23 
 
 		 878 aa  468  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  33.98 
 
 		 918 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 899 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  34.83 
 
 		 896 aa  469  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 883 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  34.67 
 
 		 908 aa  469  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  31.02 
 
 		 949 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  34.73 
 
 		 885 aa  465  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  34.32 
 
 		 875 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  36.42 
 
 		 936 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>