More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1599 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  41.53 
 
 		 875 aa  665    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.84 
 
 		 892 aa  690    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  41.07 
 
 		 903 aa  674    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  44.23 
 
 		 891 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  44.56 
 
 		 877 aa  783    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  45.34 
 
 		 876 aa  748    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  44.07 
 
 		 877 aa  777    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  44.56 
 
 		 877 aa  784    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  44.22 
 
 		 877 aa  775    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 920 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  42.02 
 
 		 880 aa  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  48.16 
 
 		 878 aa  818    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 932 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 891 aa  782    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  44.44 
 
 		 891 aa  783    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  48.27 
 
 		 876 aa  799    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  44.56 
 
 		 891 aa  785    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  42.23 
 
 		 893 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  54.1 
 
 		 878 aa  911    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  42.24 
 
 		 892 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  44.13 
 
 		 888 aa  726    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 932 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  45.51 
 
 		 876 aa  777    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  43.56 
 
 		 888 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  47.88 
 
 		 895 aa  806    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  44.53 
 
 		 850 aa  741    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  44 
 
 		 877 aa  773    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  44.46 
 
 		 891 aa  744    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  47.55 
 
 		 870 aa  800    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 928 aa  652    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 932 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  44.8 
 
 		 892 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 877 aa  782    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  44.77 
 
 		 877 aa  784    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  45.51 
 
 		 876 aa  777    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  41.74 
 
 		 903 aa  678    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  50.28 
 
 		 885 aa  837    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  43.09 
 
 		 879 aa  723    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  46.99 
 
 		 896 aa  779    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 877 aa  782    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 903 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.75 
 
 		 926 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  42.02 
 
 		 892 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  55.88 
 
 		 888 aa  987    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.45 
 
 		 928 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 929 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 885 aa  649    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  47.3 
 
 		 894 aa  818    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 920 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 928 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  46.94 
 
 		 866 aa  773    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  46.94 
 
 		 866 aa  774    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  46.78 
 
 		 873 aa  771    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  47.35 
 
 		 866 aa  794    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 893 aa  650    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  39.3 
 
 		 908 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 877 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  41.78 
 
 		 903 aa  660    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 896 aa  701    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 893 aa  639    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  42.79 
 
 		 879 aa  676    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  100 
 
 		 883 aa  1815    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 902 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  40.85 
 
 		 903 aa  669    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 893 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  43.28 
 
 		 893 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  46.89 
 
 		 872 aa  797    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 892 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 930 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 912 aa  633  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  39.32 
 
 		 909 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 934 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 896 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 939 aa  631  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 929 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 910 aa  632  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 929 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 930 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  40.07 
 
 		 933 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 896 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 890 aa  622  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  39.05 
 
 		 906 aa  624  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 930 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 931 aa  625  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 951 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 899 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 899 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 924 aa  619  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 912 aa  621  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 901 aa  621  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 910 aa  619  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 898 aa  619  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  40.22 
 
 		 917 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 899 aa  618  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 922 aa  618  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  40.22 
 
 		 923 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>