More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0882 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  100 
 
 
855 aa  1708    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  41.98 
 
 
868 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  43 
 
 
888 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  42.69 
 
 
850 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  40.97 
 
 
878 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  43.4 
 
 
870 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  40.16 
 
 
891 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.46 
 
 
883 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.07 
 
 
893 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  38.19 
 
 
903 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.44 
 
 
903 aa  596  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.72 
 
 
892 aa  596  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.1 
 
 
872 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.96 
 
 
891 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  40.53 
 
 
893 aa  592  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38.07 
 
 
903 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.89 
 
 
892 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.18 
 
 
895 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  41 
 
 
877 aa  591  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  39.07 
 
 
875 aa  583  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.52 
 
 
894 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  40.69 
 
 
866 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  40.23 
 
 
866 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.03 
 
 
912 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  39.68 
 
 
866 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  39.21 
 
 
877 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  39.1 
 
 
877 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  39.21 
 
 
891 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  39.21 
 
 
891 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  39.21 
 
 
891 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  39.21 
 
 
877 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  40.87 
 
 
878 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  39.21 
 
 
877 aa  581  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.91 
 
 
930 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.72 
 
 
903 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  39.1 
 
 
877 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  39 
 
 
877 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  38.98 
 
 
877 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.19 
 
 
888 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.65 
 
 
903 aa  572  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.89 
 
 
936 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  38.48 
 
 
908 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.88 
 
 
892 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.04 
 
 
892 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  35.1 
 
 
901 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.12 
 
 
940 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.84 
 
 
892 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  40.16 
 
 
890 aa  558  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  39.22 
 
 
902 aa  555  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  36.4 
 
 
904 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.03 
 
 
902 aa  555  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  39.11 
 
 
902 aa  552  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  36.14 
 
 
911 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.59 
 
 
926 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  38.35 
 
 
843 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  35.9 
 
 
908 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.96 
 
 
893 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  39.58 
 
 
896 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.17 
 
 
906 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  37.06 
 
 
897 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  37.22 
 
 
937 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.13 
 
 
920 aa  549  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37 
 
 
931 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.96 
 
 
928 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  37.32 
 
 
897 aa  549  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.13 
 
 
920 aa  549  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  37.95 
 
 
936 aa  543  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  36.72 
 
 
937 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  37.06 
 
 
897 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  37.07 
 
 
935 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.63 
 
 
909 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  35.65 
 
 
929 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  37.89 
 
 
898 aa  540  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  35.64 
 
 
956 aa  540  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  36.85 
 
 
916 aa  542  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  37.99 
 
 
921 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  37.5 
 
 
873 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  36.54 
 
 
899 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  36.48 
 
 
911 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  38.99 
 
 
896 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  37.13 
 
 
905 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  38.34 
 
 
846 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  38.04 
 
 
921 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.86 
 
 
930 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  35.61 
 
 
904 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.58 
 
 
950 aa  538  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  37.12 
 
 
946 aa  538  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  37.93 
 
 
921 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  34.77 
 
 
906 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  35.79 
 
 
899 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36.25 
 
 
934 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.32 
 
 
896 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  37.06 
 
 
945 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  37.93 
 
 
935 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  37.27 
 
 
930 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  37.96 
 
 
922 aa  535  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  37.93 
 
 
921 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  36.53 
 
 
928 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  37.96 
 
 
922 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  35.62 
 
 
910 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>