More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2014 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  42.54 
 
 		 878 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  66.02 
 
 		 878 aa  1183    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 868 aa  642    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 883 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 870 aa  658    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 877 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.47 
 
 		 885 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  52.37 
 
 		 912 aa  868    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  62.49 
 
 		 885 aa  1100    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 894 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 877 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  40.72 
 
 		 866 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 866 aa  662    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  100 
 
 		 875 aa  1777    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 878 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 877 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 877 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 891 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 891 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 891 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 877 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 877 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 891 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 877 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 895 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 850 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  38.66 
 
 		 872 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 877 aa  621  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 896 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 876 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 892 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 876 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 873 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  40 
 
 		 866 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 888 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 896 aa  600  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 892 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 893 aa  592  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 891 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 892 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 888 aa  589  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 855 aa  588  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 916 aa  588  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 893 aa  587  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 906 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.89 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 930 aa  581  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 934 aa  582  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  39.19 
 
 		 893 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 899 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 930 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 879 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.81 
 
 		 931 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 932 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 932 aa  571  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 899 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 843 aa  569  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40 
 
 		 912 aa  572  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 892 aa  571  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 884 aa  572  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 932 aa  572  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 929 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 929 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 940 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 939 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 928 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 918 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.97 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.13 
 
 		 903 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 901 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 928 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 928 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 928 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 903 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  37.75 
 
 		 893 aa  555  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  36.93 
 
 		 889 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 899 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  37.56 
 
 		 917 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 899 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 945 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  38.11 
 
 		 921 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 930 aa  548  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 929 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 945 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  37.75 
 
 		 922 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  37.35 
 
 		 903 aa  542  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  37.75 
 
 		 922 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 918 aa  545  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  37.64 
 
 		 923 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>