More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1421 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  41.87 
 
 		 868 aa  651    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  51.02 
 
 		 876 aa  879    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  48.65 
 
 		 877 aa  868    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  42.59 
 
 		 896 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  53.77 
 
 		 880 aa  936    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  59.57 
 
 		 888 aa  1075    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  48.55 
 
 		 891 aa  871    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  48.55 
 
 		 891 aa  871    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  48.55 
 
 		 891 aa  871    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  42.78 
 
 		 850 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 878 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  48.7 
 
 		 877 aa  864    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  48.53 
 
 		 877 aa  858    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.53 
 
 		 891 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  43.33 
 
 		 888 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  48.76 
 
 		 877 aa  863    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  48.53 
 
 		 877 aa  868    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  48.76 
 
 		 877 aa  870    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  42.13 
 
 		 894 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  51.36 
 
 		 876 aa  878    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.08 
 
 		 885 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 873 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 883 aa  701    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  43.49 
 
 		 895 aa  739    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  45.79 
 
 		 879 aa  739    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  43.67 
 
 		 870 aa  692    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  44.59 
 
 		 866 aa  711    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  44.54 
 
 		 866 aa  706    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  51.36 
 
 		 876 aa  878    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 866 aa  678    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  48.65 
 
 		 877 aa  867    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  53.54 
 
 		 877 aa  960    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  53.23 
 
 		 903 aa  937    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  100 
 
 		 896 aa  1837    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  52.85 
 
 		 893 aa  924    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  55.63 
 
 		 879 aa  977    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  49.49 
 
 		 876 aa  863    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  49.49 
 
 		 878 aa  889    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  48.76 
 
 		 877 aa  870    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.62 
 
 		 872 aa  702    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  42.42 
 
 		 930 aa  630  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.66 
 
 		 891 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.9 
 
 		 892 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 912 aa  610  1e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.9 
 
 		 892 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 878 aa  598  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 892 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 885 aa  595  1e-168  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 875 aa  591  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 892 aa  592  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 903 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 892 aa  587  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 912 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 926 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 910 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  38.07 
 
 		 901 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 906 aa  582  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 902 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.65 
 
 		 888 aa  579  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.64 
 
 		 893 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 939 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.48 
 
 		 934 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 893 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 893 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.42 
 
 		 920 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 911 aa  575  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 893 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.42 
 
 		 920 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  36.37 
 
 		 924 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 939 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 908 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 929 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  37.17 
 
 		 893 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.67 
 
 		 909 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 946 aa  569  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 930 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 929 aa  568  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 928 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 929 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  36.15 
 
 		 937 aa  563  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 916 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 939 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 929 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  36.94 
 
 		 926 aa  560  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 895 aa  560  1e-158  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 899 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 901 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 932 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 945 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 934 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 935 aa  558  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 915 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 932 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 932 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 979 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.14 
 
 		 933 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  37.84 
 
 		 904 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.36 
 
 		 903 aa  555  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 955 aa  555  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>