More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1247 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  53.26 
 
 		 877 aa  931    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  51.06 
 
 		 876 aa  875    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  50.39 
 
 		 876 aa  857    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  42.57 
 
 		 879 aa  694    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  53.37 
 
 		 877 aa  935    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  52.57 
 
 		 880 aa  881    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  42.95 
 
 		 888 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  53.03 
 
 		 891 aa  931    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  53.15 
 
 		 891 aa  932    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  42.5 
 
 		 872 aa  677    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  53.15 
 
 		 891 aa  932    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  42.22 
 
 		 870 aa  679    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  51.06 
 
 		 876 aa  875    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  44.13 
 
 		 883 aa  726    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  53.78 
 
 		 876 aa  921    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  44.48 
 
 		 895 aa  747    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 894 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  53.15 
 
 		 877 aa  932    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.87 
 
 		 885 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  53.15 
 
 		 877 aa  929    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  43.85 
 
 		 896 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  53.15 
 
 		 877 aa  932    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  53.03 
 
 		 877 aa  934    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  42.28 
 
 		 866 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  42.28 
 
 		 866 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  55.28 
 
 		 878 aa  989    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  40.79 
 
 		 866 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  100 
 
 		 888 aa  1823    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  51.52 
 
 		 877 aa  908    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  57.49 
 
 		 903 aa  1031    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  59.57 
 
 		 896 aa  1075    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  57.53 
 
 		 893 aa  1029    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  54.22 
 
 		 879 aa  934    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  52.03 
 
 		 877 aa  912    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 873 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  53.15 
 
 		 877 aa  930    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  40.66 
 
 		 868 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  40.65 
 
 		 878 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 891 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 892 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 891 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.66 
 
 		 892 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 892 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 902 aa  601  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 893 aa  592  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 893 aa  590  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 888 aa  589  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 934 aa  592  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.61 
 
 		 892 aa  592  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  38.94 
 
 		 875 aa  585  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 912 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 911 aa  581  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 928 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 932 aa  579  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 896 aa  574  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 903 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 926 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 906 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 898 aa  566  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  36.65 
 
 		 903 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  36.6 
 
 		 903 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 890 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  39 
 
 		 945 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.8 
 
 		 892 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.31 
 
 		 901 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 924 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 893 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  37.32 
 
 		 884 aa  562  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37.79 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 930 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.17 
 
 		 893 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.54 
 
 		 926 aa  555  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 904 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 908 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  36.6 
 
 		 905 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  38 
 
 		 935 aa  555  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 928 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 908 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 930 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 963 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 934 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 903 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  37.84 
 
 		 928 aa  552  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  38 
 
 		 930 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  38.07 
 
 		 912 aa  546  1e-154  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 916 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 929 aa  548  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  37.17 
 
 		 938 aa  549  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  38.28 
 
 		 918 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.65 
 
 		 903 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 936 aa  549  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 929 aa  548  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 		 923 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 930 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.62 
 
 		 909 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  38.13 
 
 		 933 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 920 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>