More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1096 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 928 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 928 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 1016 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 939 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 930 aa  661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  47.6 
 
 		 926 aa  867    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 936 aa  645    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  39.47 
 
 		 918 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 978 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 937 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 936 aa  673    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  39.21 
 
 		 968 aa  646    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 922 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 979 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  52.09 
 
 		 932 aa  1010    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  41.5 
 
 		 928 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  40.46 
 
 		 979 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 929 aa  684    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  57.78 
 
 		 939 aa  1093    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 929 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 896 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  39.3 
 
 		 931 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  41.13 
 
 		 956 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 928 aa  676    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  41.39 
 
 		 928 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 941 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  38.8 
 
 		 1024 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 932 aa  680    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 928 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  39.86 
 
 		 930 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 937 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 928 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  50.36 
 
 		 956 aa  999    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  41.26 
 
 		 945 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  40.37 
 
 		 933 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  40.13 
 
 		 924 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  44.46 
 
 		 924 aa  802    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 934 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.69 
 
 		 939 aa  705    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  40 
 
 		 924 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 921 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 928 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 973 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 921 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 937 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 936 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  50.99 
 
 		 949 aa  1005    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 928 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 930 aa  676    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.89 
 
 		 926 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 937 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  61.67 
 
 		 1024 aa  1258    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 928 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 1022 aa  677    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 921 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 928 aa  664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  38.28 
 
 		 957 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 988 aa  680    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 950 aa  653    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 934 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 928 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 932 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 921 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  39.42 
 
 		 976 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 928 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  100 
 
 		 963 aa  1984    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  60.9 
 
 		 946 aa  1180    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 930 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 951 aa  671    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 928 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 928 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 944 aa  676    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  47.17 
 
 		 945 aa  863    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 918 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  56.56 
 
 		 939 aa  1083    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 945 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 928 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 937 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  39.35 
 
 		 938 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 943 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 928 aa  676    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 932 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 942 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 903 aa  666    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 916 aa  663    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 922 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  41.31 
 
 		 923 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  39.05 
 
 		 943 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 935 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 946 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  56 
 
 		 936 aa  1094    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  39.05 
 
 		 933 aa  635  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 905 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.51 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.51 
 
 		 940 aa  629  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  39.33 
 
 		 992 aa  632  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 1000 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  38.43 
 
 		 1047 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 930 aa  632  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 1043 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>