More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0123 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  45.72 
 
 
928 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  45.72 
 
 
928 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  43.48 
 
 
930 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.15 
 
 
891 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  44.19 
 
 
915 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  43.64 
 
 
921 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  43.78 
 
 
915 aa  756    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  62.34 
 
 
940 aa  746    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  43.03 
 
 
933 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  39.98 
 
 
1022 aa  684    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  43.81 
 
 
946 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  45.72 
 
 
928 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  41.68 
 
 
936 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  43.87 
 
 
923 aa  732    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  43.76 
 
 
941 aa  723    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  100 
 
 
979 aa  2004    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  43.33 
 
 
947 aa  705    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  42.17 
 
 
925 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  43.16 
 
 
917 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  60.91 
 
 
1020 aa  1164    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  42.64 
 
 
936 aa  706    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  44.55 
 
 
917 aa  741    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  42.67 
 
 
896 aa  746    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.5 
 
 
896 aa  705    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  42.47 
 
 
921 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  42.83 
 
 
956 aa  714    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  94.28 
 
 
976 aa  1895    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  43.65 
 
 
931 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  45.56 
 
 
941 aa  764    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  44.05 
 
 
921 aa  740    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  43.12 
 
 
907 aa  723    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  61.46 
 
 
1010 aa  1211    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  62.39 
 
 
1000 aa  1235    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  99.69 
 
 
978 aa  1993    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  44.03 
 
 
935 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  57.67 
 
 
937 aa  1084    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  43.87 
 
 
891 aa  770    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  43.08 
 
 
917 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  44.51 
 
 
932 aa  763    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  43.03 
 
 
930 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  42.49 
 
 
918 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  57.98 
 
 
937 aa  1095    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  43.72 
 
 
943 aa  757    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  43.6 
 
 
939 aa  777    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  43.64 
 
 
935 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  43.58 
 
 
930 aa  741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  43.2 
 
 
934 aa  734    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.73 
 
 
892 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  42.08 
 
 
905 aa  713    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  52.06 
 
 
924 aa  899    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  44.05 
 
 
922 aa  731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  44.51 
 
 
932 aa  763    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  42.64 
 
 
922 aa  708    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  61.46 
 
 
1032 aa  1211    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  50.76 
 
 
945 aa  906    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  38.85 
 
 
944 aa  649    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  56.13 
 
 
929 aa  1026    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  42.64 
 
 
957 aa  711    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  43.97 
 
 
926 aa  769    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  61.81 
 
 
1021 aa  1212    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  43.81 
 
 
910 aa  721    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  43.06 
 
 
944 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  42.38 
 
 
913 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  44.66 
 
 
921 aa  740    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  62.22 
 
 
1033 aa  1217    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  43.7 
 
 
928 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  61.52 
 
 
1014 aa  1194    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  42.32 
 
 
988 aa  715    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  45.72 
 
 
928 aa  781    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  44.37 
 
 
937 aa  728    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  74.4 
 
 
1004 aa  1550    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  56.79 
 
 
935 aa  1060    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  49.95 
 
 
937 aa  873    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  43.06 
 
 
917 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  64.42 
 
 
979 aa  1267    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  42.63 
 
 
928 aa  736    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  74.82 
 
 
978 aa  1532    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.82 
 
 
946 aa  665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.73 
 
 
946 aa  653    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  44.35 
 
 
934 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  43.02 
 
 
951 aa  769    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  44.19 
 
 
915 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  43.95 
 
 
922 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  43.95 
 
 
922 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  56.88 
 
 
932 aa  1063    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  43.44 
 
 
918 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  56.18 
 
 
1047 aa  1076    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  57.17 
 
 
928 aa  1111    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  43.5 
 
 
917 aa  703    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  44.44 
 
 
913 aa  742    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  42.84 
 
 
927 aa  715    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  70.89 
 
 
968 aa  1451    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  41.81 
 
 
916 aa  728    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  57.46 
 
 
937 aa  1082    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  41.77 
 
 
938 aa  698    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  43.06 
 
 
917 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  42.07 
 
 
902 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  44.31 
 
 
911 aa  768    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  43.95 
 
 
922 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  51.48 
 
 
941 aa  934    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>